1983年原鹭江职业大学成立高等教育研究室，2008年更名为厦门理工学院高等教育研究所。目前挂靠规划与品质管理处，定位为学校决策的研究与咨询机构。
主要职责：
一、跟踪高等教育理论及改革发展动态，围绕建设高水平应用技术大学，研究分析高等教育发展相关政策和信息，为学校决策提供参谋咨询和信息服务；
二、围绕学校办学治校及党政中心工作，组织校内外研究力量开展相关专题研究，编辑《决策参考》，为学校改革发展提供方案建议；
三、参与学校事业发展规划编制，更名大学、二级目标管理、综合改革等综合类文稿撰写；
四、协助学校开展办学成果总结、办学思想凝练和办学治校的理论提升，撰写相关论文，组织编辑出版相关丛书等；
高等教育研究所下设发展与改革研究岗以及院校研究岗。与中国高等教育学会、福建省高等教育学会、中国高等教育学会院校研究分会等学术机构保持着密切的联系，与其他副省级城市的同类大学形成了定期研讨的机制，在向兄弟院校学习的过程中不断提升研究水平与影响力。
